Le suivi en mer des oiseaux marins est mutualisé avec celui des cétacés. Ce protocole standardisé a été mis en place en 1976 en partenariat avec le Muséum National d'Histoire Naturelle grâce aux moyens nautiques des Douanes Françaises, des Affaires Maritimes, de la Marine Nationale et de la Gendarmerie Maritime. Chaque mois, deux observateurs embarquent sur les navires des Garde-Côtes afin d'identifier, dénombrer et géolocaliser les oiseaux marins du sud du Golfe de Gascogne selon une méthodologie de line transect.
Plus de 213 374 enregistrements sont actuellement disponibles pour le golfe de Gascogne répartis sur les 12 mois de l'année (oiseaux marins et cétacés inclus). Au total, une cinquantaine d’espèces d’oiseaux marins fréquentent le secteur en fonction des saisons.
Les oiseaux du littoral de la côte basque sont également suivis depuis des stations réparties sur la côte selon un parcours standardisé entre Biarritz et Hendaye. Les observateurs scientifiques s'y rendent deux fois par mois afin de recenser les espèces, dénombrer les individus et caractériser les différents usages du littoral par les oiseaux côtiers, littoraux et estuariens. En comptant les oiseaux du littoral (gravelots, aigrettes, courlis, chevaliers, etc.), le nombre d'espèces d'oiseaux approche de la centaine.
Enfin, les oiseaux nicheurs sont également suivis depuis 1972 sur les rochers et falaises de Biarritz et Hendaye. Les principales espèces reproductrices sont le Goéland leucophée (Larus michahellis), le Cormoran huppé (Phalacrocorax aristotelis), le Martinet pâle (Apus pallidus) et le Faucon pèlerin (Falco peregrinus). L'Océanite tempête (Hydrobates pelagicus), historiquement présence jusque dans les années 2010, ne niche plus mais ses anciennes zones de nidification sont toujours surveillées.
PLAN NATIONAL D'ACTIONS
EN FAVEUR DU PUFFIN DES BALEARES
Le Puffin des Baléares est une espèce méridionale qui se reproduit uniquement sur les îles des Baléares et que l’on rencontre le long des côtes du sud du Golfe de Gascogne en période estivale et automnale. C'est une espèce protégée en danger critique d'extinction.
Depuis 2021, un Plan National d'Actions (PNA) en faveur du Puffin des Baléares, piloté par l'Office Français de la Biodiversité est mis en oeuvre.
Les données du programme ERMMA concernant cette espèce permettent d'alimenter ce PNA. Un protocole dédié est déployé par les équipes du Centre de la Mer de Biarritz afin d'améliorer les connaissances sur la répartition spatio-temporelle de l'espèce depuis la côte basque rocheuse jusqu'au Bassin d'Arcachon en passant par les abords du Gouf de Capbreton.
Les données acquises sur les oiseaux marins et littoraux servent directement les gestionnaires des Aires Marines Protégées locales ainsi que les services de l'Etat ou encore l'Office Français de la Biodiversité.
Ces informations sont cruciales pour répondre aux exigences des Directives européennes, notamment la Directive Oiseaux et la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin. Les différents suivis de l'ERMMA permettent en effet de répondre à des critères de population d'évolution, d'impacts des pollutions (marées noire, polluants aux métaux lourds, déchets dans les nids...) ou encore d'aménagements (énergies marines renouvelables...)